Targeted Next-Generation Resequencing of Gene Identifies Novel Multiple Variants Pattern in Severe Hereditary Factor V Deficiency

基因 遗传学 医学 计算生物学 生物信息学 生物
作者
Piotr K. Janicki,Sonia Vaida,Hamid Al‐Mondhiry
出处
期刊:Case reports in genetics [Hindawi Publishing Corporation]
卷期号:2013: 1-7 被引量:4
标识
DOI:10.1155/2013/941684
摘要

The present study investigated the genetic defects underlying severe Factor V deficiency in a 26-year-old Columbian (South America) female and her immediate family (both parents and newborn child) by next generation sequencing (NGS) of the entire F5 gene locus. Five mutations in the coding sequence of F5, including three missense single-nucleotide variants (R2102H, R513K, D107H) and two synonymous variants (A135A , S184S), were identified and confirmed by the Sanger sequencing in the investigated proband (homozygote for all detected mutations), her parents, and her newborn child (all heterozygotic carriers for identified mutations). Each of the three missense variants was previously associated with separate phenotypes, including Factor V deficiency (R2102H), thrombosis (R513K) and frequent miscarriages (D107H). In addition, at least 75 additional single-nucleotide variants (including six novels) were identified in untranslated region of F5.
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