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Study on the allosteric activation mechanism of SHP2 via elastic network models and neural relational inference molecular dynamics simulation

变构调节 推论 粒度 分子动力学 人工神经网络 计算机科学 化学 生物系统 计算化学 统计物理学 人工智能 物理 生物 生物化学 操作系统
作者
Ling Liu,Yan Cheng,Zhigang Zhang,Jinyan Li,Yichao Geng,Qingsong Li,Dong Luo,Li Liang,Wei Liu,J. H. Hu,Weiwei Ouyang
出处
期刊:Physical Chemistry Chemical Physics [The Royal Society of Chemistry]
卷期号:25 (35): 23588-23601 被引量:1
标识
DOI:10.1039/d3cp02795c
摘要

Above, the open-state protein of SHP2(SHP2*) was constructed from SHP1, and the allosteric process of SHP2 was investigated by coarse-graining and NRI-MD modeling.
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