Promiscuity Guided Evolution of Decarboxylative Aldolases for Synthesis of Tertiary γ‐Hydroxy Amino Acids

定向进化 活动站点 电泳剂 饱和突变 醛缩酶A 立体化学 氨基酸 化学 突变 酶动力学 蛋白质工程 基质(水族馆) 生物化学 药效团 生物 突变体 催化作用 基因 生态学
作者
Meghan E. Campbell,Amanda Ohler,Matthew J. McGill,Andrew R. Buller
出处
期刊:Angewandte Chemie [Wiley]
被引量:2
标识
DOI:10.1002/anie.202422109
摘要

Many applications of enzymes benefit from activity on structurally diverse substrates. Here, we sought to engineer the decarboxylative aldolase UstD to perform a challenging C‐C bond forming reaction with ketone electrophiles. The parent enzyme had only low levels of activity, portending multiple rounds of directed evolution and a possibility that mutations may inadvertently increase the specificity of the enzyme for a single model screening substrate. We show how to intentionally guide UstD towards generality through multi‐generational directed evolution using substrate‐multiplexed screening (SUMS). Mutations outside of the active site that impact catalytic function were immediately revealed by shifts in promiscuity, even when the overall activity was lower. By re‐targeting these distal residues that couple to the active site with saturation mutagenesis, broadly activating mutations were readily identified. When analyzing active site mutants, SUMS identified both specialist enzymes that would have more limited utility as well as generalist enzymes with complementary activity on diverse substrates. These new UstD enzymes catalyze convergent synthesis of non‐canonical amino acids bearing tertiary alcohol side chains. This methodology is easy to implement and enables the rapid and effective evolution of enzymes to catalyze desirable new functions.

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