Intrinsically disordered protein regions and phase separation: sequence determinants of assembly or lack thereof

内在无序蛋白质 背景(考古学) 化学物理 相(物质) 分子间力 序列(生物学) 蛋白质结构 结构生物学 化学 生物物理学 物理 生物 生物化学 分子 古生物学 有机化学
作者
Erik W. Martin,Alex S. Holehouse
出处
期刊:Emerging topics in life sciences [Portland Press]
卷期号:4 (3): 307-329 被引量:214
标识
DOI:10.1042/etls20190164
摘要

Intrinsically disordered protein regions (IDRs) — regions that do not fold into a fixed three-dimensional structure but instead exist in a heterogeneous ensemble of conformations — have recently entered mainstream cell biology in the context of liquid–liquid phase separation (LLPS). IDRs are frequently found to be enriched in phase-separated compartments. Due to this observation, the presence of an IDR in a protein is frequently assumed to be diagnostic of its ability to phase separate. In this review, we clarify the role of IDRs in biological assembly and explore the physical principles through which amino acids can confer the attractive molecular interactions that underlie phase separation. While some disordered regions will robustly drive phase separation, many others will not. We emphasize that rather than ‘disorder' driving phase separation, multivalency drives phase separation. As such, whether or not a disordered region is capable of driving phase separation will depend on the physical chemistry encoded within its amino acid sequence. Consequently, an in-depth understanding of that physical chemistry is a prerequisite to make informed inferences on how and why an IDR may be involved in phase separation or, more generally, in protein-mediated intermolecular interactions.
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