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Discovery,Identification and Comparative Analysis of Non-Specific Lipid Transfer Protein (nsLtp) Family in Solanaceae
作者
Wanfei,
Liu,
Dawei,
Huang,
Kan Kan,
Songnian,
Hu -,
Jun Jun,
Fujun Yu,
Gäng,
Gao,
Shu-Hui,
Song
出处
期刊:基因组蛋白质组与生物信息学报:英文版
日期:2010-01-01
卷期号:8 (4): 229-237
被引量:2
链接
cqvip.com
摘要
植物非特定的类脂化合物转移蛋白质(nsLtps ) 被报导了对细菌、真菌的病原体涉及植物防卫活动。在这研究,我们识别了 135 (122 通常认为并且 13 以前识别了) Solanaceae nsLtps,它被聚类进 8 个不同的组。由与 Boutrot 的 nsLtp 分类作比较,我们分类这八个组进五种类型(我, II, IV, IX 和 X ) 。我们把 Solanaceae nsLtps 与 Arabi-dopsis 和 Gramineae nsLtps 作比较并且发现(1 ) 那打字我, II 和 IV 被 Solanaceae, Gramineae 和 Arabidopsis 分享;(2 ) 类型 III, V, VI 和 VIII 被 Gramineae 和 Arabidopsis 分享然而并非到目前为止在 Solanaceae 检测了;(3 ) 而类型 IX 在 Arabidopsis 和 Solanaceae 仅仅是在场的,类型 VII 仅仅在 Gramineae 被发现;(4 ) 类型 X 是在我们的数据说明 52.59% Solanaceae nsLtps 的一种新类型,并且到目前为止没在任何另外的植物被报导。我们进一步造了并且比较了八个组的三维的结构,并且发现在 nsLtp 家庭以内的主要功能的多样化能被早于到 monocot/dicot 分叉,并且许多基因复制和顺序变化在 monocot/dicot 分叉以后发生在 nsLtp 家庭,特别在 Solanaceae。
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