The VP2 protein exhibits cross-interaction to the VP1 protein in norovirus GII.17

衣壳 高变区 诺如病毒 生物 蛋白质-蛋白质相互作用 病毒学 蛋白质结构域 计算生物学 病毒 遗传学 抗体 基因
作者
Yingyin Liao,Linping Wang,Xiaojing Hong,Junshan Gao,Yueting Zuo,Yanhui Liang,Yueting Jiang,Jumei Zhang,Aiwu Wu,Liang Xue,Xiaoxia Kou
出处
期刊:Infection, Genetics and Evolution [Elsevier]
卷期号:100: 105265-105265 被引量:9
标识
DOI:10.1016/j.meegid.2022.105265
摘要

Norovirus is a major cause of acute gastroenteritis worldwide. Like the major capsid protein (VP1), the minor capsid protein (VP2) also contains a hypervariable domain. Generally, a hypervariable domain is functionally driven. However, many functions of VP2 remain unknown and worth exploring. Without sufficient sequences and an available crystallographic model, it is difficult to explore VP2's mysteries. As a helper of stabilizing and coordinating the formation of virus-like particles (VLPs), we asked whether VP2 interacted with the major capsid protein (VP1) in GII.17 and if so, what the key interaction residues were. Here, we reported cross-interaction among four strains represented four clusters of GII.17, and the VP1 interaction domain of VP2 (174-179aa) was found. However, the VP1 interaction domain of VP2 was not universal in different clusters of GII.17. VP2 might evolve in a different pattern from VP1. Additionally, in contrast to previous reports, we found that VP2 localized in the cytoplasm. More possibilities of VP2 should be further explored.
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