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Marinivivus vitaminiproducens gen. nov., sp. nov., a vitamin B12-producing bacterium isolated from the coral Fungia sp. in South China Sea

生物 珊瑚 中国 细菌 中国海 微生物学 植物 生态学 海洋学 遗传学 考古 历史 地质学
作者
Songbiao Shi,Linni Jian,Qi Zeng,Yi Jiang,Lijuan Long,Xinpeng Tian
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:75 (8)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006878
摘要

A Gram-stain-negative, aerobic, non-motile and short rod-shaped bacterium, designated strain SCSIO 64248 T , was isolated from the stony coral Fungia sp. collected from South China Sea. Phylogenetic analysis indicated that strain SCSIO 64248 T belonged to the family Geminicoccaceae and showed the highest 16S rRNA gene similarities with the types of Marinimicrococcus flavescens (90.5%), Arboricoccus pini (90.2%) and Benzoalithermus flavus (89.8%). The whole genome of strain SCSIO 64248 T was 4.9 Mbp with a 68.8mol% G+C content. It shared average amino acid identity (AAI) values of 52–56.2%, which is below the proposed AAI threshold at the genus level and when compared to the known species of Geminicoccaceae . Colonies of strain SCSIO 64248 T are circular, pink and convex. It was able to grow in the range of 4–37 °C, at pH 6.0–10.0 and in the presence of up to 8.0% (w/v) NaCl concentration. The major cellular fatty acid (>9%) was summed feature 8, C 19 : 0 cyclo ω 8 c and C 16 : 0 , and the sole respiratory quinone was Q-10. The polar lipids were phosphatidylglycerol, phosphatidylethanolamine, phosphatidylcholine and an unidentified phospholipid. Data of polyphasic characteristics revealed that strain SCSIO 64248 T represented a novel species of a new genus within the family Geminicoccaceae , for which the name Marinivivus gen. nov. is proposed with the type strain of the type species Marinivivus vitaminiproducens SCSIO 64248 T (=MCCC 1K08013 T =KCTC 92503 T ).
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