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Thermodynamic Modeling and Experimental Data Reveal That Sugars Stabilize Proteins According to an Excluded Volume Mechanism

化学 排除体积 体积热力学 解耦(概率) 热力学 渗透压 聚合物 计算化学 有机化学 生物化学 物理 工程类 控制工程
作者
Andrea Arsiccio,Tim Sarter,Ilaria Polidori,Gerhard Winter,Roberto Pisano,Joan‐Emma Shea
出处
期刊:Journal of the American Chemical Society [American Chemical Society]
卷期号:145 (30): 16678-16690 被引量:8
标识
DOI:10.1021/jacs.3c04293
摘要

We present a new thermodynamic model to investigate the relative effects of excluded volume and soft interaction contributions in determining whether a cosolute will either destabilize or stabilize a protein in solution. This model is unique in considering an atomistically detailed model of the protein and accounting for the preferential accumulation/exclusion of the osmolyte molecules from the protein surface. Importantly, we use molecular dynamics simulations and experiments to validate the model. The experimental approach presents a unique means of decoupling excluded volume and soft interaction contributions using a linear polymeric series of cosolutes with different numbers of glucose subunits, from 1 (glucose) to 8 (maltooctaose), as well as an 8-mer of glucose units in the closed form (γ-CD). By studying the stabilizing effect of cosolutes along this polymeric series using lysozyme as a model protein, we validate the thermodynamic model and show that sugars stabilize proteins according to an excluded volume mechanism.
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