Kitasatospora hibisci sp. nov., a novel actinomycete with antimicrobial potential isolated from rhizosphere soil of Hibiscus tiliaceus in Guangxi

生物 根际 16S核糖体RNA 拉伤 植物 木槿 细菌 微生物学 遗传学 解剖
作者
Jinlan Xiao,Yongrui Lin,Shujie Luo,Shiqi Lu,Zhiwei Hong,Jiyang Wang,Zhikai Guo,Shuangqing Zhou,Xiaolong Huang
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:75 (5)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006787
摘要

A novel Kitasatospora strain, designated as HNM1077 T , was isolated from rhizosphere soil of Hibiscus tiliaceus collected from the bank of the Beilun River in Dongxing City, Guangxi Province, China. The novel strain exhibited antimicrobial activity against a wide range of microbes, particularly Gram­-negative bacteria and plant pathogenic fungi. Based on the alignment of 16S rRNA gene sequences, strain HNM1077 T was closely related to Kitasatospora aburaviensis NRRL B-2218 T (99.51%). Comparisons based on genome sequencing showed that strain HNM1077 T was distinguished from its nearest species by average nucleotide identity of 94.36% and a digital DNA–DNA hybridization value of 54.3%. The G+C content of strain HNM1077 T was 73.1 mol%. The main fatty acids of strain HNM1077 T were iso -C 15:0 (21.5%), anteiso -C 15:0 (11.7%), iso -C 16:0 (8.6%), iso -C 17:0 (9.3%) and anteiso -C 17:0 (8.7%). The predominant menaquinone was MK-9 (H 8 ). The major polar lipids of strain HNM1077 T consisted of phosphatidylethanolamine, phosphatidylinositol, diphosphatidylglycerol and glycosylphosphatidylinositol. Based on these polyphasic taxonomic results, strain HNM1077 T represents a novel Kitasatospora species, for which the name Kitasatospora hibisci sp. nov. is proposed. The type strain is HNM1077 T (=CCTCC AA 2024052 T =KCTC 59330 T ).
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