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Comprehensive Consensus Analysis of SARS-CoV-2 Drug Repurposing Campaigns

药物发现 冠状病毒 药品 计算机科学 药物开发 2019-20冠状病毒爆发 大流行 病毒学
作者
Hazem Mslati,Francesco Gentile,Carl F. Perez,Artem Cherkasov
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
卷期号:61 (8): 3771-3788 被引量:15
标识
DOI:10.1021/acs.jcim.1c00384
摘要

The current COVID-19 pandemic has elicited extensive repurposing efforts (both small and large scale) to rapidly identify COVID-19 treatments among approved drugs. Herein, we provide a literature review of large-scale SARS-CoV-2 antiviral drug repurposing efforts and highlight a marked lack of consistent potency reporting. This variability indicates the importance of standardizing best practices—including the use of relevant cell lines, viral isolates, and validated screening protocols. We further surveyed available biochemical and virtual screening studies against SARS-CoV-2 targets (Spike, ACE2, RdRp, PLpro, and Mpro) and discuss repurposing candidates exhibiting consistent activity across diverse, triaging assays and predictive models. Moreover, we examine repurposed drugs and their efficacy against COVID-19 and the outcomes of representative repurposed drugs in clinical trials. Finally, we propose a drug repurposing pipeline to encourage the implementation of standard methods to fast-track the discovery of candidates and to ensure reproducible results.
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