Integrating Bulk and Single-Cell Transcriptomics with Machine Learning Reveals a Heme Metabolism-Based Panel for Lung Adenocarcinoma Chemotherapy Resistance

转录组 腺癌 化疗 血红素 新陈代谢 癌症研究 医学 生物 肿瘤科 内科学 癌症 生物化学 基因 基因表达
作者
Lin Zhao,Haibo Han,Xuantong Zhou,Tongyang Gong,Yuge Zhu,Bufan Xiao,Shuchang Liu,Wei Zhao,Nan Wu
出处
期刊:International Journal of Molecular Sciences [Multidisciplinary Digital Publishing Institute]
卷期号:26 (10): 4685-4685
标识
DOI:10.3390/ijms26104685
摘要

Lung adenocarcinoma (LUAD) is a leading cause of cancer-related mortality, with heme metabolism playing a critical role in tumor progression and treatment resistance. This study investigates the clinical implications of heme metabolism in LUAD, focusing on its link to ferroptosis and drug sensitivity. Using multi-omics data from TCGA-LUAD, GEO databases, and a single-cell RNA-seq cohort, we identified two molecular subtypes based on heme metabolism-related genes. We further developed a prognostic panel, termed the heme metabolism risk score (HMRS), using LASSO and multivariate Cox regression analyses. The HMRS panel effectively stratified patients into high- and low-risk groups, with high-risk patients showing enhanced tumor proliferation, suppressed ferroptosis, and resistance to chemotherapy. Single-cell analysis revealed elevated heme metabolism risk in epithelial cells correlated with tumor progression. Drug sensitivity predictions were validated in platinum-based chemotherapy cohorts, confirming HMRS as a robust prognostic tool. ABCC2 was identified as a key regulator of ferroptosis and cisplatin resistance, with in vitro experiments demonstrating that ABCC2 knockdown enhanced cisplatin-induced ferroptosis. These findings highlight HMRS as a critical tool for patient stratification and ABCC2 as a promising therapeutic target to overcome cisplatin resistance.

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