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Genetische und epigenetische Eigenschaften von Kopf-Hals-Tumoren mit unterschiedlichen molekularen Immunsignaturen

作者
Julia Heß,Bohai Feng,Y Shen,Xavier Pastor Hostench,Matthias Bieg,Michaela Maria Plath,N Ishaque,R Eils,Kolja Freier,Wilko Weichert,K Zaoui
出处
期刊:Laryngo-rhino-otologie [Thieme Medical Publishers (Germany)]
标识
DOI:10.1055/s-0041-1727833
摘要

Einleitung Die maligne Progression bei Krebs zeichnet sich durch ein komplexes Gleichgewicht zwischen Aktivität und Toleranz des Immunsystems aus. Die zugrundeliegenden molekularen Prinzipien bei der Entstehung des tumorspezifischen Immunphänotyps ist jedoch weitgehend unbekannt. Methoden Ein molekularer Klassifikator wurde basierend auf Subpopulationen von Immunzellen und deren Assoziation mit der CD274 und IFNG Expression trainiert. Genetische und epigenetische Unterschiede sowie differenziell exprimierte Gene (DEGs) abhängig vom Immunphänotyp wurden durch integrative Analyse von Multiomics-Daten identifizieren. Eine prognostische Gensignatur wurde über ein LASSO ( least absolute shrinkage and selection operator ) COX Regressionsmodell etabliert. Ergebnisse Tumoren mit bzw. ohne zytotoxischen Immunphänotyp sind durch spezifische somatische Mutationen sowie genomische Aberrationen charakterisiert. Funktionelle Genomanalysen identifizierten EGFR (epidermal growth factor receptor) und PTGS2 (prostaglandin-endoperoxide synthase 2) als Schlüsselproteine von Netzwerken mit Einfluss auf den Immunphänotyp. Zusätzlich beeinflussen EGFR Inhibitoren die Expression von Genen mit variabler Regulation zwischen Tumoren mit bzw. ohne zytotoxischen Immunphänotyp. ۢer ein LASSO-Cox Regressionsmodell basierend auf DEGs zwischen Patienten mit und ohne Tumorprogress unter ICI Therapie wurde eine prognostische Gensignatur etabliert. Schlussfolgerung Die Studie bestätigt die Komplexität von genetischen und epigenetischen Veränderungen bei der Etablierung des tumorspezifischen Immunphänotyps und liefert experimentelle Hinweise, dass HNSCC-Patienten mit hohem Risiko für Therapieversagen unter ICI von einer Inhibition EGFR- bzw. PTGS2-abhängiger Signalkaskaden profitieren könnten. Poster-PDF A-1531.pdf „Gesetzten Vortrag“ aus der Heidelberger Univ. HNO-Klinik Publication History Publication Date: 13 May 2021 (online) © . Georg Thieme Verlag KG Rüdigerstraße 14, 70469 Stuttgart, Germany

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