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Interplay of chromatin organization and mechanics of the cell nucleus

常染色质 核心 染色质 异染色质 细胞核 支架/基质附着区域 染色质重塑 细胞生物学 化学 物理 生物 生物物理学 遗传学 DNA
作者
Marco De Corato,María José Gómez‐Benito
出处
期刊:Biophysical Journal [Elsevier BV]
卷期号:123 (19): 3386-3396 被引量:3
标识
DOI:10.1016/j.bpj.2024.08.003
摘要

The nucleus of eukaryotic cells is constantly subjected to different kinds of mechanical stimuli, which can impact the organization of chromatin and, subsequently, the expression of genetic information. Experiments from different groups showed that nuclear deformation can lead to transient or permanent condensation or decondensation of chromatin and to the mechanical activation of genes, thus altering the transcription of proteins. Changes in chromatin organization, in turn, change the mechanical properties of the nucleus, possibly leading to an auxetic behavior. Here, we model the mechanics of the nucleus as a chemically-active polymer gel in which the chromatin can exist in two states: a self-attractive state representing the heterochromatin and a repulsive state representing euchromatin. The model predicts reversible or irreversible changes in chromatin condensation levels upon external deformations of the nucleus. We find an auxetic response for a broad range of parameters under small and large deformations. These results agree with experimental observations and highlight the key role of chromatin organization in the mechanical response of the nucleus.
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