Integrated bioinformatic analysis identifies ferroptosis-related biomarkers and subtypes in invasive aspergillosis

免疫系统 生物 曲菌病 基因 计算生物学 先天免疫系统 生物发生 细胞 核糖体生物发生 免疫学 获得性免疫系统 转录因子 转录组 生物信息学 机制(生物学) 遗传学 炎症 DNA
作者
Lu Tang,Luying Yang,Weiwei Qian
出处
期刊:Toxicology Research [Oxford University Press]
卷期号:15 (1): tfag009-tfag009
标识
DOI:10.1093/toxres/tfag009
摘要

Invasive aspergillosis (IA) is a severe fungal infection with complex pathogenesis, and the role of ferroptosis, an iron-dependent regulated cell death, in IA remains largely unexplored. This study investigates the association between ferroptosis and IA using a bioinformatics approach. We analyzed the GSE78000 dataset to assess ferroptosis activity and identify differentially expressed genes (DEGs). Ferroptosis-related genes (FRGs) were curated from literature, and protein-protein interaction (PPI) networks and functional enrichment analyses (GO and KEGG) were performed. Three machine learning algorithms (SVM, LASSO, and Random Forest) identified five core FRGs (KIF20A, PEBP1, HMOX1, MTF1, QSOX1), which exhibited excellent diagnostic potential (AUCs: 0.884-0.981). IA patients were categorized into two ferroptosis-related subtypes (C1 and C2), characterized by distinct molecular profiles and pathway enrichments, such as ribosome biogenesis and DNA replication. Immune cell infiltration analysis, using ssGSEA, revealed significant alterations in IA, with increased innate immune cells (macrophages, neutrophils) positively correlating with core FRG expression, while adaptive immune cells (B cells, T cells) were decreased. Our findings indicate that ferroptosis is critically involved in IA pathogenesis, with identified core FRGs serving as promising diagnostic biomarkers. The revealed heterogeneity among IA patients and the interaction between ferroptosis and the immune microenvironment provide new insights into the disease's molecular mechanisms and potential therapeutic targets for further investigation.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Ke发布了新的文献求助10
刚刚
SophieLiu发布了新的文献求助10
1秒前
2秒前
3秒前
嘎嘣脆发布了新的文献求助10
3秒前
路痴发布了新的文献求助10
3秒前
yy家的小哥哥完成签到,获得积分10
4秒前
4秒前
SherlockJia的应助被123采纳,获得10
4秒前
小盐精完成签到,获得积分10
5秒前
hotjeely完成签到,获得积分10
6秒前
十三发布了新的文献求助10
6秒前
6秒前
6秒前
没有神的过往完成签到,获得积分10
8秒前
fan发布了新的文献求助10
8秒前
嗯嗯完成签到 ,获得积分10
9秒前
9秒前
坚强孤容发布了新的文献求助10
11秒前
打打的应助被自由抽屉采纳,获得10
11秒前
window1000发布了新的文献求助10
11秒前
佳佳发布了新的文献求助10
12秒前
hkk的应助被ZYX采纳,获得10
12秒前
楚楚爸完成签到,获得积分10
13秒前
MCY完成签到,获得积分10
13秒前
13秒前
一号完成签到,获得积分10
13秒前
流觞曲水发布了新的文献求助10
14秒前
落后的硬币完成签到,获得积分10
15秒前
nom完成签到,获得积分10
15秒前
CipherSage的应助被WYZ采纳,获得10
15秒前
15秒前
16秒前
16秒前
123完成签到,获得积分10
16秒前
丸子判官完成签到,获得积分10
18秒前
张土豆完成签到,获得积分10
18秒前
1111111发布了新的文献求助10
19秒前
琉光完成签到,获得积分10
19秒前
staceylululu完成签到,获得积分10
19秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Energie-Contracting 1500
Klimaschutzrecht durch den Energiesektor im Mehrebenensystem – Ein Rechtsvergleich 1000
Oncology Clinical Trials: Successful Design, Conduct, and Analysis, Second Edition 800
Stochastic Models in Operations Research,Vol. 2 600
Organizational Behavior 510
桑白皮エキスの実験的, 臨床的育毛効果について 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 计算机科学 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 物理 复合材料 内科学 催化作用 光电子学 人工智能 细胞生物学 无机化学 物理化学 数学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 8044306
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9476134
关于积分的说明 21282336
捐赠科研通 7612014
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3391981
关于科研通互助平台的介绍 2523576
邀请新用户注册赠送积分活动 2429888