Pulmonary Effects of Traumatic Brain Injury in Mice: A Gene Set Enrichment Analysis

下调和上调 转录组 病理 炎症 免疫系统 生物 纤维化 创伤性脑损伤 基因表达谱 微阵列 肌成纤维细胞 基因表达 特发性肺纤维化 微阵列分析技术 医学 免疫学 基因 内科学 遗传学 精神科
作者
Wei‐Hung Chan,Shih‐Ming Huang,Yi‐Lin Chiu
出处
期刊:International Journal of Molecular Sciences [Multidisciplinary Digital Publishing Institute]
卷期号:25 (5): 3018-3018 被引量:3
标识
DOI:10.3390/ijms25053018
摘要

Acute lung injury occurs in 20-25% of cases following traumatic brain injury (TBI). We investigated changes in lung transcriptome expression post-TBI using animal models and bioinformatics. Employing unilateral controlled cortical impact for TBI, we conducted microarray analysis after lung acquisition, followed by gene set enrichment analysis of differentially expressed genes. Our findings indicate significant upregulation of inflammation-related genes and downregulation of nervous system genes. There was enhanced infiltration of adaptive immune cells, evidenced by positive enrichment in Lung-Th1, CD4, and CD8 T cells. Analysis using the Tabula Sapiens database revealed enrichment in lung-adventitial cells, pericytes, myofibroblasts, and fibroblasts, indicating potential effects on lung vasculature and fibrosis. Gene set enrichment analysis linked TBI to lung diseases, notably idiopathic pulmonary hypertension. A Venn diagram overlap analysis identified a common set of 20 genes, with FOSL2 showing the most significant fold change. Additionally, we observed a significant increase in ADRA1AIL6 production post-TBI using the L1000 library. Our study highlights the impact of brain trauma on lung injury, revealing crucial gene expression changes related to immune cell infiltration, cytokine production, and potential alterations in lung vasculature and fibrosis, along with a specific spectrum of disease influence.
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