Engineering thermostable ( R )-selective amine transaminase from Aspergillus terreus through in silico design employing B-factor and folding free energy calculations

土曲霉 热稳定性 转氨酶 胺气处理 蛋白质工程 化学 折叠(DSP实现) 突变体 突变 定向进化 蛋白质折叠 立体化学 组合化学 生物化学 有机化学 工程类 电气工程 基因
作者
Jun Huang,Dong‐Fang Xie,Yan Feng
出处
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications [Elsevier BV]
卷期号:483 (1): 397-402 被引量:76
标识
DOI:10.1016/j.bbrc.2016.12.131
摘要

Amine transaminases have recently gained a lot of attention for the synthesis of chiral amines. Using (R)-selective amine transaminase from Aspergillus terreus (AT-ATA) as a transaminase model, in silico design was applied employing B-factor and folding free energy (ΔΔGfold) calculations. Mutation sites were selected by targeting flexible regions with the greatest B-factors, and were substituted with amino acids that were determined by folding free energy calculations (ΔΔGfold < 0) to be more rigid than the original ones. By site-directed mutagenesis, we obtained four stabilized mutants (T130M, T130F, E133F and D134L) with improved stability from 19 candidates. Compared to the wild type, the best single mutant (T130M) showed an increase in thermal stability with a nearly 2.2-fold improvement of half-life (t1/2) at 40 °C and a 3.5 °C higher T1/210 min. The optimum catalytic temperature of T130F was increased by 10 °C. In addition, the T130M/E133F double mutant displayed the largest shift in thermostability with 3.3-fold improvement of t1/2 at 40 °C and a 5.0 °C higher T1/210 min. Modeling analysis showed that new hydrophobic interactions and hydrogen bonds might contribute to the observed thermostability improvement.
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