Pharmacophore modeling, virtual screening and molecular docking of ATPase inhibitors of HSP70

药效团 虚拟筛选 对接(动物) 李宾斯基五定律 化学 立体化学 ATP酶 生物信息学 分子模型 蛋白质数据库 自动停靠 计算生物学 分子动力学 生物化学 蛋白质-配体对接 药物发现 分子力学 组合化学 小分子 热休克蛋白90 生物 医学 基因 护理部
作者
K. N. Sangeetha,R. Sasikala,K. Meena
出处
期刊:Computational Biology and Chemistry [Elsevier BV]
卷期号:70: 164-174 被引量:6
标识
DOI:10.1016/j.compbiolchem.2017.05.011
摘要

Heat shock protein 70 is an effective anticancer target as it influences many signaling pathways. Hence the study investigated the important pharmacophore feature required for ATPase inhibitors of HSP70 by generating a ligand based pharmacophore model followed by virtual based screening and subsequent validation by molecular docking in Discovery studio V4.0. The most extrapolative pharmacophore model (hypotheses 8) consisted of four hydrogen bond acceptors. Further validation by external test set prediction identified 200 hits from Mini Maybridge, Drug Diverse, SCPDB compounds and Phytochemicals. Consequently, the screened compounds were refined by rule of five, ADMET and molecular docking to retain the best competitive hits. Finally Phytochemical compounds Muricatetrocin B, Diacetylphiladelphicalactone C, Eleutheroside B and 5-(3-{[1-(benzylsulfonyl)piperidin-4-yl]amino}phenyl)- 4-bromo-3-(carboxymethoxy)thiophene-2-carboxylic acid were obtained as leads to inhibit the ATPase activity of HSP70 in our findings and thus can be proposed for further in vitro and in vivo evaluation.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
大能猫完成签到,获得积分10
1秒前
南浅发布了新的文献求助20
1秒前
hhh完成签到 ,获得积分10
1秒前
1秒前
万能图书馆应助淡然寒风采纳,获得10
2秒前
爆米花应助希芜采纳,获得10
3秒前
3秒前
小柳发布了新的文献求助30
4秒前
諵来北往发布了新的文献求助10
4秒前
4秒前
iitj发布了新的文献求助10
4秒前
5秒前
白泽完成签到,获得积分10
6秒前
WAHXY完成签到,获得积分10
6秒前
申雪狐完成签到,获得积分20
6秒前
贺丞完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
lyy完成签到,获得积分20
6秒前
7秒前
7秒前
8秒前
8秒前
搞怪白猫完成签到,获得积分10
8秒前
贺丞发布了新的文献求助10
8秒前
小马甲应助諵来北往采纳,获得10
8秒前
meng完成签到 ,获得积分10
9秒前
9秒前
10秒前
11秒前
niyl发布了新的文献求助10
11秒前
11秒前
Akim应助搞怪白猫采纳,获得10
11秒前
berry发布了新的文献求助10
12秒前
夏紊完成签到,获得积分0
13秒前
Eason发布了新的文献求助10
13秒前
14秒前
taipingyang发布了新的文献求助10
14秒前
15秒前
严怜梦发布了新的文献求助10
15秒前
16秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Encyclopedia of Cardiovascular Research and Medicine(2e) 820
自動車の空力技術 800
Essentials of Carbohydrate Chemistry and Biochemistry, 4th Edition 800
Organizational Behavior 510
Management and the Arts 510
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition Second Edition 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 计算机科学 化学工程 工程类 有机化学 物理 复合材料 生物化学 内科学 细胞生物学 基因 遗传学 免疫学 冶金 光电子学 癌症研究
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7781130
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9321050
关于积分的说明 20380802
捐赠科研通 7368699
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3319977
关于科研通互助平台的介绍 2467795
邀请新用户注册赠送积分活动 2335809