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Construction of a membrane yeast two-hybrid library and its application in identification of PsARRO-1-interacting proteins in tree peony

双分子荧光互补 cDNA文库 酵母 互补 双杂交筛选 基因组文库 基因 生物 互补DNA 拟南芥 酿酒酵母 基因亚型 分子生物学 细胞生物学 计算生物学 遗传学 表型 肽序列 突变体
作者
Huiqin Wang,Zheng Wang,Xue Lou,Songlin He
出处
期刊:Journal of Horticultural Science & Biotechnology [Taylor & Francis]
卷期号:98 (1): 72-86
标识
DOI:10.1080/14620316.2022.2092561
摘要

To investigate the molecular mechanism of the ADVENTITIOUS ROOTING RELATED OXYGENASE 1 (ARRO-1) gene in adventitious rooting of tree peony, the PsARRO-1 gene was isolated from Paeonia ostii. Subsequently, a yeast two-hybrid (Y2H) cDNA library using the split-ubiquitin yeast membrane system was constructed, the insert fragments lengths of pPR3-N membrane Y2H library were mainly concentrated between 500 and 3,000 bp, and the library capacity reached 1.3 × 107 CFUs, with an efficiency of recombinant of 100%, which met the requirements for subsequent screening of PsARRO-1-interacting proteins. Finally, 15 candidate PsARRO-1-interacting proteins were screened out by pBT3SUC-ARRO, among them potassium transporter 2, cytochrome b5 isoform E, and high mobility group B protein 3 (HMGB3) might be involved in the formation of roots. Both direct Y2H and bimolecular fluorescence complementation assays confirmed that PsARRO-1 interacted with PsHMGB3, which shared high identity with EgHMGB3 and MiHMGB3. The expression of PsHMGB3 was significantly up-regulated in the root outgrowth stage, and the overexpression of PsHMGB3 in Arabidopsis resulted in lengthened primary roots, more lateral roots. In short, the Y2H library provides a large number of useful resources for functional genomics research on roots of tree peony.
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