Cloning and Expression Analysis of ATG8 (Autophagy-Related 8) Gene Family in Solanaceae

ATG8型 生物 基因 遗传学 基因家族 茄科 自噬 基因表达 细胞生物学 细胞凋亡
作者
Ya-Han Chen,Yunshuang Lu,Shibo Dong,Chengde Yang,Shunyi Yang
出处
期刊:Plants [Multidisciplinary Digital Publishing Institute]
卷期号:13 (20): 2924-2924
标识
DOI:10.3390/plants13202924
摘要

The autophagy-related gene family ATG8 (Autophagy-related 8) plays an important role in plant growth, development, and stress response. In this study, 15 ATG8 gene family sequences were amplified from Solanaceae, namely tobacco, tomato, and pepper, using RT-PCR to evaluate their basic properties, protein structure, and function, as well as the role of ATG8 in autophagy. The physicochemical properties, the predicted secondary and tertiary protein structures, subcellular localisation, gene structures, conserved motifs, and phylogenetic relationships of the ATG8 genes were analysed using bioinformatic techniques, and their expression patterns under sericin-induced plant disease resistance were investigated by RT-qPCR. The lengths of these proteins ranged from 79 to 120 aa, while their predicted molecular weights and isoelectric points (PI) ranged from 9283.62 to 13,778.74 and 6.32 to 11.44, respectively. The majority of the proteins were localised in the nucleus or chloroplasts. Conserved protein motifs and various cis-regulatory elements in the protein, with a wide range of related functions, were identified. The ATG8 gene family members showed expression changes after treatment with osthole, which induces disease resistance in tobacco, tomato, and pepper. These findings provide a foundation for further analyses of the ATG8 gene family in Solanaceae and the mechanism underlying the response to adverse conditions.
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